
《蛋白質(zhì)結(jié)合位點預(yù)測及輔助分子對接》是一本深入研究蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)、功能和相互作用的專業(yè)書籍。書中首先對蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)進(jìn)行了全面介紹,包括一級結(jié)構(gòu)、二級結(jié)構(gòu)、三級結(jié)構(gòu)和四級結(jié)構(gòu),并對蛋白質(zhì)穩(wěn)定性以及結(jié)構(gòu)分析與穩(wěn)定性分析進(jìn)行了詳細(xì)討論。在此基礎(chǔ)上,本書探討了配體-受體相互作用原理,包括受體-配體結(jié)合的關(guān)鍵點和結(jié)合過程理論模型。
接下來,本書詳細(xì)介紹了蛋白質(zhì)結(jié)合位點預(yù)測的研究現(xiàn)狀,特別是蛋白質(zhì)-配體和蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)結(jié)合位點的預(yù)測方法。在此基礎(chǔ)上,作者提出了本研究的主要工作,包括基于氨基酸組成偏好的配體結(jié)合口袋識別方法、使用隨機(jī)森林方法進(jìn)行蛋白質(zhì)結(jié)合位點的預(yù)測、殘基聚類方法及其在蛋白質(zhì)結(jié)合位點預(yù)測中的應(yīng)用,以及蛋白質(zhì)結(jié)合位點預(yù)測輔助分子對接。
在后續(xù)章節(jié)中,本書詳細(xì)介紹了各種基于數(shù)據(jù)聚類的蛋白質(zhì)結(jié)合位點識別方法,包括簡單迭代方法優(yōu)化蛋白質(zhì)-配體結(jié)合位點識別和基于最小協(xié)方差行列式(MCD)和馬氏距離的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)結(jié)合位點識別等。最后,本書探討了蛋白質(zhì)結(jié)合位點預(yù)測及輔助分子對接的方法,包括結(jié)合位點預(yù)測信息前端使用輔助蛋白質(zhì)-配體對接和結(jié)合位點預(yù)測信息后端使用輔助蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)對接。
本書還對研究工作進(jìn)行總結(jié),并展望了未來研究的方向。書中的研究成果對于理解蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能,以及設(shè)計新的藥物和治療方法具有重要意義。